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frontiers图文攻略frontiers第十一关

2023-01-25 02:16:29

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原来云同学的生识

要分散你的注意力并不容易

我们做过几份基因信件的分析主要是用干的和干的材料做的如果你想让这类文章获得高分的话

思鲁定计

我想知道如何设计如何连结热点我不知道如何分析热点

要获得原始的私人信函库,请执行以下操作

2022年4月发表:PV多组分析、透明肾癌的导管家族预测及生物学功能

背景调查

即时受体电位(TRP)通道参与检测各种细胞和外界刺激,TRPV1-6家族参与肿瘤的形成和进展,Trp等。透明细胞性肾癌(ccrcc)的生物学功能和可预测价值目前未知

资料来源

65432 + 4R

研究流动的过程

最大的水果

1.TRPV家族的基因图谱

首先,我们发现了基于GTEx的TRPV1-6数据库在正常器官和组织中的分布,然后我们发现了Trp v1-6(GEP 1)在肿瘤和正常组织之间的分布,并使用tcga-kirc队列和GSE

图1: TRPV家族在正常人体组织和肿瘤组织中的分布

图2:CCRC中的trv家族基因

2.Trp家族的基因改变和蛋白质网络

使用cBioportal工具评估538个KIRC实例中的更改频率,该网络显示PV家族与20个可能的目标基因的交互作用,表明TRPV家族可能是其中一个最重要的成员

图3 trpvs的基因组变化和基因和PPI网络配置

3. ccrcc中TRPV家族生存分析

CCRC单因素回归分析显示TRPV1和TRPV3表达较高,多变量Cox回归分析显示TRPV3表达较高,TRPV3表达较低是CCRC患者的OS独立危险因素,tiger-Meier分析显示Trp-Meier表达较高

图4:CCRC中Trp家庭生存分析

4.TRPV家族在ccrcc中的预测和识别意义

由于TRPV3和TRPV4是潜在的生物学家,作者开发了一列TRPV3/4表达式和TNM循环来预测ccrcc患者的总寿命

0次

图5 TRPV家族在ccrcc中的预测和诊断值

5. ccrcc患者的TRPV3表达与临床参数相关

使用IHC染色体验证CCRC组织与正常组织之间的TRPV3蛋白水平表达,GSCA数据库使用TRPV1-6表达的CCRC病理时间的关系评估TRPV3表达的临床价值

65432 + 111

图6 Trp v3与临床参数相关联

6. ccrcc中TRPV3的DNA甲基化分析

通过使用GSCA工具分析TRPV3甲基化和TRPV3 mRNA,我们发现trpv3 mrna甲基化可以参与CCRC和CCRC患者的预测

65432 + 129

图7:CCRC中TRPV3的DNA甲基化分析

7. ccrcc中的丰富功能分析3C

使用TCGA-KIRC队列对DEGs执行GO和kegg富集分析,以识别低表达组之间的537个变化

65432 + 133

图8:CCRC中与TRPV3相关的常规群集的功能富集分析

8. ccrcc中Trp的免疫渗透分析

根据gse73731资料集,使用ticib软体演算法分析ccrcc样本中22个肿瘤的免疫细胞比率,每22个TRPV3-low群组和TRPV3-high群组之间的10个比率都不同

65432 + 143

图9在ccrcc中的TRPV3。免疫细胞修复分析

9.TRPV3和免疫控制之间的联系

使用GGPlot 2" R包来评估TRPV3与免疫检查点的关系

65432 + 155号

图10:在ccrcc中,TRPV3表示式与免疫控制点相关联

在ccrcc中建立snhg 3/al737.1-mir-10b- 5p Trp v3轴

通过在线网站,TRPV3的上游预测miRNA和lncRNA,免疫30

65432 + 161号

65432 + 171号

图11:snhg 3/al497.1-mir-10b- 5p-Trp v3轴的配置

一篇小文章

本研究利用基因家族分析和单基因多组分析(转录组)来分析想法,使其对自然热症免疫于微环境

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